Для аминокислот известны два вида изомерии: структурная и пространственная (оптическая изомерия).
Структурная изомерия
Структурная изомерия связана с особенностями строения углеродного скелета и взаимным расположением функциональных групп.
1. Изомерия углеродного скелета
2. Изомерия положения аминогруппы
Оптическая изомерия
Все α-аминокислоты, кроме глицина H2N-CH2-COOH, содержат асимметрический атом углерода (a-атом) и могут существовать в виде оптических изомеров (зеркальных антиподов).
Оптическая изомерия природных α-аминокислот играет важную роль в процессах биосинтеза белка.